Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 LINC00437-201ENST00000414161 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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PTPRNQ16849 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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PTPRNQ16849 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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PTPRNQ16849 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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PTPRNQ16849 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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PTPRNQ16849 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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PTPRNQ16849 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRNQ16849 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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