Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC13.18□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
GABRA6Q16445 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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