Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ERV3-1Q14264 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms