Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 GYG1-210ENST00000484197 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 SLC3A1-208ENST00000410056 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 AC004690.2-201ENST00000472838 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 DPM1-203ENST00000371588 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 TRIM60P17-201ENST00000415181 719 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 ART2P-201ENST00000415521 822 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 AL450003.1-201ENST00000439447 455 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 VDAC1P13-201ENST00000447826 859 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 LINC02224-201ENST00000505706 584 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 TRIQK-213ENST00000521617 774 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 AP003102.1-201ENST00000525638 661 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 LINC01917-201ENST00000565170 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 AC124319.1-201ENST00000576808 653 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 AL157778.1-201ENST00000626665 729 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 RPS27L-208ENST00000635699 693 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms