Protein–RNA interactions for Protein: Q01658

DR1, Protein Dr1, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DR1Q01658 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DR1Q01658 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DR1Q01658 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DR1Q01658 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DR1Q01658 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DR1Q01658 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DR1Q01658 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DR1Q01658 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DR1Q01658 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DR1Q01658 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DR1Q01658 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DR1Q01658 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DR1Q01658 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DR1Q01658 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DR1Q01658 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DR1Q01658 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DR1Q01658 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DR1Q01658 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DR1Q01658 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DR1Q01658 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DR1Q01658 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DR1Q01658 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DR1Q01658 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DR1Q01658 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DR1Q01658 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DR1Q01658 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DR1Q01658 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DR1Q01658 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DR1Q01658 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DR1Q01658 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DR1Q01658 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DR1Q01658 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DR1Q01658 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DR1Q01658 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DR1Q01658 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
DR1Q01658 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DR1Q01658 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DR1Q01658 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DR1Q01658 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DR1Q01658 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DR1Q01658 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DR1Q01658 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
DR1Q01658 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DR1Q01658 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DR1Q01658 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DR1Q01658 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DR1Q01658 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DR1Q01658 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DR1Q01658 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DR1Q01658 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DR1Q01658 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DR1Q01658 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DR1Q01658 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DR1Q01658 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
DR1Q01658 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DR1Q01658 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DR1Q01658 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DR1Q01658 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DR1Q01658 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DR1Q01658 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DR1Q01658 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DR1Q01658 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DR1Q01658 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DR1Q01658 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DR1Q01658 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DR1Q01658 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DR1Q01658 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DR1Q01658 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DR1Q01658 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DR1Q01658 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DR1Q01658 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DR1Q01658 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DR1Q01658 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
DR1Q01658 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DR1Q01658 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DR1Q01658 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DR1Q01658 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DR1Q01658 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DR1Q01658 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DR1Q01658 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DR1Q01658 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DR1Q01658 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DR1Q01658 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DR1Q01658 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
DR1Q01658 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DR1Q01658 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DR1Q01658 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DR1Q01658 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DR1Q01658 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
DR1Q01658 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
DR1Q01658 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
DR1Q01658 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DR1Q01658 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DR1Q01658 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DR1Q01658 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DR1Q01658 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DR1Q01658 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DR1Q01658 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DR1Q01658 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DR1Q01658 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms