Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
COPAP53621 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
COPAP53621 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPAP53621 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPAP53621 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPAP53621 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPAP53621 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPAP53621 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPAP53621 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPAP53621 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPAP53621 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPAP53621 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
COPAP53621 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPAP53621 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
COPAP53621 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPAP53621 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPAP53621 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPAP53621 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPAP53621 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPAP53621 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPAP53621 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPAP53621 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
COPAP53621 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
COPAP53621 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
COPAP53621 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPAP53621 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPAP53621 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPAP53621 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPAP53621 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPAP53621 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPAP53621 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPAP53621 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPAP53621 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPAP53621 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPAP53621 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPAP53621 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPAP53621 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPAP53621 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPAP53621 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPAP53621 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPAP53621 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPAP53621 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPAP53621 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPAP53621 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPAP53621 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
COPAP53621 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPAP53621 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPAP53621 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPAP53621 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPAP53621 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPAP53621 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPAP53621 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPAP53621 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPAP53621 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPAP53621 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
COPAP53621 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPAP53621 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPAP53621 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPAP53621 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
COPAP53621 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPAP53621 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPAP53621 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPAP53621 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPAP53621 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPAP53621 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPAP53621 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPAP53621 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPAP53621 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPAP53621 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPAP53621 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
COPAP53621 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPAP53621 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPAP53621 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPAP53621 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPAP53621 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
COPAP53621 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
COPAP53621 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPAP53621 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPAP53621 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPAP53621 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPAP53621 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPAP53621 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPAP53621 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPAP53621 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPAP53621 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPAP53621 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPAP53621 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPAP53621 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
COPAP53621 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPAP53621 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPAP53621 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPAP53621 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPAP53621 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPAP53621 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPAP53621 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPAP53621 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPAP53621 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPAP53621 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPAP53621 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPAP53621 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms