Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK11BP21127 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK11BP21127 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK11BP21127 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK11BP21127 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK11BP21127 PRPF38A-201ENST00000257181 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK11BP21127 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK11BP21127 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK11BP21127 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK11BP21127 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK11BP21127 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK11BP21127 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK11BP21127 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK11BP21127 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK11BP21127 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK11BP21127 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK11BP21127 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK11BP21127 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK11BP21127 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK11BP21127 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK11BP21127 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK11BP21127 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK11BP21127 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK11BP21127 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK11BP21127 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK11BP21127 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK11BP21127 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK11BP21127 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK11BP21127 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK11BP21127 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK11BP21127 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK11BP21127 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK11BP21127 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK11BP21127 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK11BP21127 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK11BP21127 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK11BP21127 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK11BP21127 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK11BP21127 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK11BP21127 CACNA1G-225ENST00000512389 6837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK11BP21127 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK11BP21127 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK11BP21127 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK11BP21127 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK11BP21127 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK11BP21127 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK11BP21127 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDK11BP21127 ABI2-202ENST00000261017 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 ADAMTSL1-205ENST00000380548 8030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 SLC4A1-201ENST00000262418 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 CHL1-201ENST00000256509 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 ADCY7-202ENST00000394697 6213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 CCDC88C-204ENST00000389857 7474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 DGKD-202ENST00000409813 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDK11BP21127 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms