Protein–RNA interactions for Protein: P15976

GATA1, Erythroid transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA1P15976 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
GATA1P15976 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
GATA1P15976 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
GATA1P15976 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GATA1P15976 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
GATA1P15976 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GATA1P15976 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
GATA1P15976 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GATA1P15976 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GATA1P15976 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
GATA1P15976 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
GATA1P15976 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
GATA1P15976 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GATA1P15976 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GATA1P15976 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
GATA1P15976 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GATA1P15976 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GATA1P15976 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GATA1P15976 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GATA1P15976 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GATA1P15976 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
GATA1P15976 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
GATA1P15976 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GATA1P15976 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GATA1P15976 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GATA1P15976 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GATA1P15976 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GATA1P15976 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GATA1P15976 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GATA1P15976 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GATA1P15976 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
GATA1P15976 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
GATA1P15976 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GATA1P15976 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
GATA1P15976 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
GATA1P15976 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
GATA1P15976 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
GATA1P15976 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
GATA1P15976 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
GATA1P15976 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
GATA1P15976 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GATA1P15976 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GATA1P15976 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GATA1P15976 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GATA1P15976 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
GATA1P15976 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GATA1P15976 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
GATA1P15976 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
GATA1P15976 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
GATA1P15976 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GATA1P15976 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GATA1P15976 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
GATA1P15976 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GATA1P15976 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GATA1P15976 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GATA1P15976 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
GATA1P15976 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GATA1P15976 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
GATA1P15976 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GATA1P15976 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
GATA1P15976 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GATA1P15976 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
GATA1P15976 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
GATA1P15976 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GATA1P15976 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GATA1P15976 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GATA1P15976 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GATA1P15976 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
GATA1P15976 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GATA1P15976 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GATA1P15976 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
GATA1P15976 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GATA1P15976 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GATA1P15976 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GATA1P15976 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
GATA1P15976 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
GATA1P15976 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
GATA1P15976 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
GATA1P15976 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
GATA1P15976 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GATA1P15976 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GATA1P15976 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GATA1P15976 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
GATA1P15976 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GATA1P15976 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
GATA1P15976 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
GATA1P15976 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GATA1P15976 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
GATA1P15976 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
GATA1P15976 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
GATA1P15976 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GATA1P15976 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GATA1P15976 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GATA1P15976 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GATA1P15976 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
GATA1P15976 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
GATA1P15976 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GATA1P15976 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
GATA1P15976 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GATA1P15976 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms