Protein–RNA interactions for Protein: P01374

LTA, Lymphotoxin-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTAP01374 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LTAP01374 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LTAP01374 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LTAP01374 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LTAP01374 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LTAP01374 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LTAP01374 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LTAP01374 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LTAP01374 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
LTAP01374 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LTAP01374 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LTAP01374 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LTAP01374 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LTAP01374 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LTAP01374 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
LTAP01374 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
LTAP01374 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
LTAP01374 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LTAP01374 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LTAP01374 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LTAP01374 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LTAP01374 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LTAP01374 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LTAP01374 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LTAP01374 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LTAP01374 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
LTAP01374 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LTAP01374 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LTAP01374 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LTAP01374 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LTAP01374 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LTAP01374 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LTAP01374 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LTAP01374 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LTAP01374 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LTAP01374 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LTAP01374 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LTAP01374 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LTAP01374 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LTAP01374 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LTAP01374 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LTAP01374 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LTAP01374 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LTAP01374 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LTAP01374 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LTAP01374 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LTAP01374 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
LTAP01374 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LTAP01374 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LTAP01374 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LTAP01374 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
LTAP01374 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LTAP01374 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LTAP01374 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LTAP01374 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LTAP01374 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LTAP01374 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LTAP01374 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LTAP01374 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LTAP01374 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LTAP01374 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LTAP01374 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LTAP01374 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LTAP01374 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LTAP01374 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LTAP01374 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LTAP01374 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LTAP01374 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LTAP01374 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LTAP01374 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LTAP01374 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LTAP01374 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LTAP01374 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LTAP01374 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LTAP01374 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LTAP01374 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LTAP01374 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LTAP01374 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LTAP01374 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LTAP01374 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LTAP01374 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LTAP01374 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LTAP01374 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LTAP01374 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LTAP01374 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LTAP01374 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LTAP01374 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LTAP01374 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LTAP01374 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LTAP01374 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LTAP01374 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
LTAP01374 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LTAP01374 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LTAP01374 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LTAP01374 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LTAP01374 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LTAP01374 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LTAP01374 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LTAP01374 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LTAP01374 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms