Protein–RNA interactions for Protein: O75712

GJB3, Gap junction beta-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB3O75712 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJB3O75712 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJB3O75712 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJB3O75712 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJB3O75712 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJB3O75712 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJB3O75712 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GJB3O75712 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GJB3O75712 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GJB3O75712 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GJB3O75712 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GJB3O75712 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GJB3O75712 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GJB3O75712 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GJB3O75712 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GJB3O75712 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJB3O75712 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJB3O75712 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJB3O75712 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJB3O75712 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJB3O75712 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJB3O75712 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJB3O75712 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJB3O75712 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJB3O75712 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJB3O75712 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJB3O75712 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJB3O75712 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GJB3O75712 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GJB3O75712 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GJB3O75712 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJB3O75712 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJB3O75712 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJB3O75712 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJB3O75712 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJB3O75712 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJB3O75712 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GJB3O75712 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJB3O75712 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJB3O75712 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GJB3O75712 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJB3O75712 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJB3O75712 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJB3O75712 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJB3O75712 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJB3O75712 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJB3O75712 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJB3O75712 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJB3O75712 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJB3O75712 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJB3O75712 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJB3O75712 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GJB3O75712 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJB3O75712 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJB3O75712 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJB3O75712 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJB3O75712 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJB3O75712 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJB3O75712 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GJB3O75712 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJB3O75712 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJB3O75712 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJB3O75712 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJB3O75712 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJB3O75712 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJB3O75712 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJB3O75712 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJB3O75712 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJB3O75712 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJB3O75712 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJB3O75712 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJB3O75712 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJB3O75712 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJB3O75712 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJB3O75712 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJB3O75712 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJB3O75712 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJB3O75712 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJB3O75712 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GJB3O75712 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJB3O75712 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJB3O75712 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJB3O75712 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJB3O75712 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJB3O75712 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJB3O75712 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJB3O75712 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJB3O75712 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJB3O75712 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJB3O75712 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJB3O75712 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJB3O75712 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJB3O75712 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJB3O75712 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJB3O75712 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJB3O75712 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJB3O75712 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJB3O75712 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJB3O75712 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GJB3O75712 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms