Protein–RNA interactions for Protein: O00451

GFRA2, GDNF family receptor alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA2O00451 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms