Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms