Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE4

IARS2, Isoleucine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,012 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IARS2Q9NSE4 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IARS2Q9NSE4 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
IARS2Q9NSE4 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IARS2Q9NSE4 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IARS2Q9NSE4 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IARS2Q9NSE4 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IARS2Q9NSE4 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IARS2Q9NSE4 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IARS2Q9NSE4 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IARS2Q9NSE4 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IARS2Q9NSE4 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IARS2Q9NSE4 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IARS2Q9NSE4 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IARS2Q9NSE4 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IARS2Q9NSE4 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IARS2Q9NSE4 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IARS2Q9NSE4 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IARS2Q9NSE4 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
IARS2Q9NSE4 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IARS2Q9NSE4 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IARS2Q9NSE4 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IARS2Q9NSE4 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IARS2Q9NSE4 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IARS2Q9NSE4 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IARS2Q9NSE4 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IARS2Q9NSE4 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IARS2Q9NSE4 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IARS2Q9NSE4 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IARS2Q9NSE4 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IARS2Q9NSE4 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IARS2Q9NSE4 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IARS2Q9NSE4 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IARS2Q9NSE4 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IARS2Q9NSE4 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IARS2Q9NSE4 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IARS2Q9NSE4 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IARS2Q9NSE4 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IARS2Q9NSE4 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IARS2Q9NSE4 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
IARS2Q9NSE4 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IARS2Q9NSE4 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IARS2Q9NSE4 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IARS2Q9NSE4 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IARS2Q9NSE4 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IARS2Q9NSE4 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IARS2Q9NSE4 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IARS2Q9NSE4 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IARS2Q9NSE4 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IARS2Q9NSE4 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IARS2Q9NSE4 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IARS2Q9NSE4 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IARS2Q9NSE4 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IARS2Q9NSE4 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IARS2Q9NSE4 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IARS2Q9NSE4 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IARS2Q9NSE4 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IARS2Q9NSE4 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IARS2Q9NSE4 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
IARS2Q9NSE4 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
IARS2Q9NSE4 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
IARS2Q9NSE4 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IARS2Q9NSE4 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IARS2Q9NSE4 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IARS2Q9NSE4 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IARS2Q9NSE4 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IARS2Q9NSE4 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IARS2Q9NSE4 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IARS2Q9NSE4 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
IARS2Q9NSE4 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IARS2Q9NSE4 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IARS2Q9NSE4 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IARS2Q9NSE4 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IARS2Q9NSE4 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IARS2Q9NSE4 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IARS2Q9NSE4 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IARS2Q9NSE4 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IARS2Q9NSE4 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IARS2Q9NSE4 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IARS2Q9NSE4 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IARS2Q9NSE4 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IARS2Q9NSE4 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IARS2Q9NSE4 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IARS2Q9NSE4 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IARS2Q9NSE4 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IARS2Q9NSE4 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IARS2Q9NSE4 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IARS2Q9NSE4 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IARS2Q9NSE4 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IARS2Q9NSE4 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IARS2Q9NSE4 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IARS2Q9NSE4 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IARS2Q9NSE4 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IARS2Q9NSE4 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IARS2Q9NSE4 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IARS2Q9NSE4 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IARS2Q9NSE4 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IARS2Q9NSE4 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IARS2Q9NSE4 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IARS2Q9NSE4 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IARS2Q9NSE4 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 619.6 ms