Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95 ms