Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUF5

TUBB6, Tubulin beta-6 chain, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB6Q9BUF5 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBB6Q9BUF5 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBB6Q9BUF5 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBB6Q9BUF5 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBB6Q9BUF5 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBB6Q9BUF5 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBB6Q9BUF5 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBB6Q9BUF5 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBB6Q9BUF5 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBB6Q9BUF5 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBB6Q9BUF5 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TUBB6Q9BUF5 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TUBB6Q9BUF5 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TUBB6Q9BUF5 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TUBB6Q9BUF5 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TUBB6Q9BUF5 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TUBB6Q9BUF5 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TUBB6Q9BUF5 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB6Q9BUF5 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB6Q9BUF5 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB6Q9BUF5 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB6Q9BUF5 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB6Q9BUF5 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB6Q9BUF5 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB6Q9BUF5 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB6Q9BUF5 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB6Q9BUF5 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB6Q9BUF5 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB6Q9BUF5 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB6Q9BUF5 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB6Q9BUF5 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB6Q9BUF5 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB6Q9BUF5 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB6Q9BUF5 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB6Q9BUF5 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB6Q9BUF5 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB6Q9BUF5 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB6Q9BUF5 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB6Q9BUF5 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB6Q9BUF5 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB6Q9BUF5 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB6Q9BUF5 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB6Q9BUF5 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB6Q9BUF5 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB6Q9BUF5 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB6Q9BUF5 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB6Q9BUF5 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB6Q9BUF5 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB6Q9BUF5 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB6Q9BUF5 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB6Q9BUF5 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB6Q9BUF5 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB6Q9BUF5 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB6Q9BUF5 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB6Q9BUF5 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB6Q9BUF5 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB6Q9BUF5 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB6Q9BUF5 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB6Q9BUF5 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB6Q9BUF5 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB6Q9BUF5 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB6Q9BUF5 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB6Q9BUF5 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB6Q9BUF5 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB6Q9BUF5 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB6Q9BUF5 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB6Q9BUF5 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB6Q9BUF5 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB6Q9BUF5 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB6Q9BUF5 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB6Q9BUF5 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB6Q9BUF5 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB6Q9BUF5 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB6Q9BUF5 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB6Q9BUF5 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB6Q9BUF5 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB6Q9BUF5 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB6Q9BUF5 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB6Q9BUF5 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB6Q9BUF5 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB6Q9BUF5 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB6Q9BUF5 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB6Q9BUF5 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB6Q9BUF5 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB6Q9BUF5 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB6Q9BUF5 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB6Q9BUF5 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB6Q9BUF5 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB6Q9BUF5 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB6Q9BUF5 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB6Q9BUF5 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB6Q9BUF5 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB6Q9BUF5 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB6Q9BUF5 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB6Q9BUF5 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB6Q9BUF5 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB6Q9BUF5 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB6Q9BUF5 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB6Q9BUF5 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB6Q9BUF5 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms