Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
RNF185Q96GF1 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms