Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5U6

RNF10, RING finger protein 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 811 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF10Q8N5U6 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF10Q8N5U6 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms