Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VSTM1Q6UX27 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VSTM1Q6UX27 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VSTM1Q6UX27 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VSTM1Q6UX27 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VSTM1Q6UX27 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VSTM1Q6UX27 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VSTM1Q6UX27 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VSTM1Q6UX27 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VSTM1Q6UX27 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VSTM1Q6UX27 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VSTM1Q6UX27 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VSTM1Q6UX27 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VSTM1Q6UX27 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VSTM1Q6UX27 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VSTM1Q6UX27 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VSTM1Q6UX27 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VSTM1Q6UX27 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VSTM1Q6UX27 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VSTM1Q6UX27 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VSTM1Q6UX27 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VSTM1Q6UX27 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VSTM1Q6UX27 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VSTM1Q6UX27 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VSTM1Q6UX27 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VSTM1Q6UX27 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VSTM1Q6UX27 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VSTM1Q6UX27 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VSTM1Q6UX27 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VSTM1Q6UX27 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VSTM1Q6UX27 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VSTM1Q6UX27 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VSTM1Q6UX27 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VSTM1Q6UX27 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VSTM1Q6UX27 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VSTM1Q6UX27 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VSTM1Q6UX27 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VSTM1Q6UX27 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VSTM1Q6UX27 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VSTM1Q6UX27 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VSTM1Q6UX27 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VSTM1Q6UX27 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VSTM1Q6UX27 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSTM1Q6UX27 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSTM1Q6UX27 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSTM1Q6UX27 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSTM1Q6UX27 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSTM1Q6UX27 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSTM1Q6UX27 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSTM1Q6UX27 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSTM1Q6UX27 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSTM1Q6UX27 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSTM1Q6UX27 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSTM1Q6UX27 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSTM1Q6UX27 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VSTM1Q6UX27 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSTM1Q6UX27 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSTM1Q6UX27 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSTM1Q6UX27 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSTM1Q6UX27 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VSTM1Q6UX27 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSTM1Q6UX27 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSTM1Q6UX27 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSTM1Q6UX27 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSTM1Q6UX27 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSTM1Q6UX27 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSTM1Q6UX27 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSTM1Q6UX27 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VSTM1Q6UX27 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSTM1Q6UX27 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSTM1Q6UX27 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSTM1Q6UX27 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VSTM1Q6UX27 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VSTM1Q6UX27 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSTM1Q6UX27 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSTM1Q6UX27 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VSTM1Q6UX27 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSTM1Q6UX27 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSTM1Q6UX27 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSTM1Q6UX27 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSTM1Q6UX27 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSTM1Q6UX27 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSTM1Q6UX27 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSTM1Q6UX27 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSTM1Q6UX27 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSTM1Q6UX27 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSTM1Q6UX27 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSTM1Q6UX27 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSTM1Q6UX27 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSTM1Q6UX27 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSTM1Q6UX27 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSTM1Q6UX27 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms