Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TWISTNBQ3B726 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TWISTNBQ3B726 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms