Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
IMPG1Q17R60 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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