Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP2B3Q16720 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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