Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 ABHD17A-203ENST00000588598 5425 ntTSL 219.09■□□□□ 0.658e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 AATK-202ENST00000374792 4938 ntTSL 219.05■□□□□ 0.648e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.643e-7■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.68e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 SEPT9-214ENST00000586456 545 ntTSL 218.7■□□□□ 0.588e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.578e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.573e-8■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.568e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.528e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 RSRC1-208ENST00000476899 788 ntTSL 518.29■□□□□ 0.528e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.528e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 ASNA1-203ENST00000590633 592 ntTSL 218.27■□□□□ 0.528e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.512e-7■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.58e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 RAB40C-207ENST00000563109 710 ntTSL 318.1■□□□□ 0.498e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 AVL9-207ENST00000485228 489 ntTSL 518.06■□□□□ 0.488e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 PACSIN3-208ENST00000531226 654 ntTSL 518.06■□□□□ 0.488e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.488e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 NOTUM-204ENST00000489218 972 ntTSL 217.94■□□□□ 0.461e-10■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 PRR14-205ENST00000563399 554 ntTSL 417.92■□□□□ 0.468e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.451e-10■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 TNK2-207ENST00000427576 541 ntTSL 317.85■□□□□ 0.458e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 ZGPAT-205ENST00000431125 427 ntTSL 217.81■□□□□ 0.448e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 TMEM259-205ENST00000586704 2538 ntTSL 517.62■□□□□ 0.413e-7■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 TMEM259-211ENST00000593068 1965 ntTSL 517.62■□□□□ 0.413e-7■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 RPS24-208ENST00000475468 623 ntTSL 517.59■□□□□ 0.418e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 SFXN1-208ENST00000507823 2611 ntTSL 217.47■□□□□ 0.398e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.383e-8■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 ZHX1-203ENST00000480132 496 ntTSL 417.35■□□□□ 0.378e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 POLR3H-209ENST00000483837 1829 ntTSL 517.26■□□□□ 0.358e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 ABHD17A-205ENST00000591351 4647 ntTSL 217.26■□□□□ 0.358e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 AC126755.1-203ENST00000538220 558 ntTSL 216.88■□□□□ 0.298e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.298e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 PACSIN3-202ENST00000524509 554 ntTSL 316.85■□□□□ 0.298e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.288e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 C19orf25-212ENST00000592605 357 ntTSL 316.79■□□□□ 0.288e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.288e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 LARP4-212ENST00000548174 584 ntTSL 316.76■□□□□ 0.271e-10■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.268e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.268e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.258e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.258e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.248e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 LEMD2-206ENST00000506578 1684 ntTSL 516.53■□□□□ 0.243e-8■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 ZCWPW2-203ENST00000420223 816 ntTSL 516.45■□□□□ 0.228e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.198e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 ASNA1-202ENST00000586561 848 ntTSL 216.24■□□□□ 0.198e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.188e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 ZSWIM8-205ENST00000433366 5773 ntTSL 516.11■□□□□ 0.178e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.168e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 CTDSPL-204ENST00000435525 371 ntTSL 315.94■□□□□ 0.148e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.138e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.128e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 ZHX1-C8orf76-202ENST00000622816 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 415.74■□□□□ 0.118e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 TULP4-204ENST00000613390 804 ntTSL 515.73■□□□□ 0.118e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 TNFRSF19-205ENST00000464735 660 ntTSL 215.43■□□□□ 0.062e-7■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.048e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 PRR14-212ENST00000569864 528 ntTSL 315.29■□□□□ 0.048e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 SFT2D1-202ENST00000478705 659 ntTSL 215.16■□□□□ 0.028e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 LARP4-214ENST00000548993 790 ntTSL 514.98□□□□□ -0.011e-10■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 C19orf25-208ENST00000589421 492 ntTSL 214.97□□□□□ -0.018e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 LARP4-217ENST00000551886 586 ntTSL 214.96□□□□□ -0.011e-10■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.028e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.028e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 RACK1-203ENST00000502844 1460 ntTSL 314.89□□□□□ -0.038e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 AVL9-204ENST00000459629 7937 ntTSL 214.81□□□□□ -0.048e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.048e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 CENPT-223ENST00000566758 858 ntTSL 514.73□□□□□ -0.058e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.068e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 RPRD1B-203ENST00000462548 2436 ntTSL 514.68□□□□□ -0.068e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 TNFRSF12A-207ENST00000575836 161 ntTSL 314.68□□□□□ -0.068e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.078e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 AL139353.1-203ENST00000547760 749 ntTSL 314.62□□□□□ -0.078e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 RAB40C-202ENST00000509637 565 ntTSL 314.51□□□□□ -0.098e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.18e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 ACTN1-217ENST00000556203 564 ntTSL 314.36□□□□□ -0.118e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.118e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.131e-10■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 ZHX1-207ENST00000524267 614 ntTSL 414.26□□□□□ -0.138e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 VGLL4-212ENST00000437722 544 ntTSL 314.1□□□□□ -0.158e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.158e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.178e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.178e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.178e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.188e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 SLC25A10-204ENST00000570310 595 ntTSL 313.87□□□□□ -0.198e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 PRR14-204ENST00000563211 786 ntTSL 513.83□□□□□ -0.28e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 PHACTR4-209ENST00000633371 597 ntTSL 313.81□□□□□ -0.28e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.218e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.218e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 SLC25A10-208ENST00000574884 726 ntTSL 513.68□□□□□ -0.228e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.248e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 AC126755.1-202ENST00000545152 586 ntTSL 213.53□□□□□ -0.248e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 MICAL3-213ENST00000577821 807 ntTSL 313.48□□□□□ -0.258e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 HDAC4-205ENST00000454542 565 ntTSL 413.46□□□□□ -0.258e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 CENPT-211ENST00000564128 2673 ntTSL 213.39□□□□□ -0.278e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 CNBP-210ENST00000512338 502 ntTSL 413.36□□□□□ -0.278e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 RACK1-230ENST00000513060 1651 ntTSL 513.23□□□□□ -0.298e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.298e-6■■□□□ 13.7
PCBP2Q15366 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.38e-6■■□□□ 13.7
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