Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CTTNQ14247 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms