Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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CDH18Q13634 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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CDH18Q13634 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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CDH18Q13634 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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CDH18Q13634 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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CDH18Q13634 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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CDH18Q13634 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH18Q13634 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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