Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TOP3AQ13472 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
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