Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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CLN3Q13286 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 SULT1A1-211ENST00000569554 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CLN3Q13286 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
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