Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NME3Q13232 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NME3Q13232 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NME3Q13232 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NME3Q13232 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NME3Q13232 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NME3Q13232 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NME3Q13232 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NME3Q13232 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NME3Q13232 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NME3Q13232 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NME3Q13232 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NME3Q13232 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NME3Q13232 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NME3Q13232 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NME3Q13232 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NME3Q13232 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NME3Q13232 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NME3Q13232 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NME3Q13232 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NME3Q13232 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NME3Q13232 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NME3Q13232 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NME3Q13232 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NME3Q13232 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NME3Q13232 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NME3Q13232 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NME3Q13232 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NME3Q13232 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NME3Q13232 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NME3Q13232 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NME3Q13232 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NME3Q13232 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NME3Q13232 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NME3Q13232 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NME3Q13232 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NME3Q13232 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NME3Q13232 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NME3Q13232 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NME3Q13232 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NME3Q13232 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NME3Q13232 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NME3Q13232 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NME3Q13232 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NME3Q13232 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NME3Q13232 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NME3Q13232 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NME3Q13232 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NME3Q13232 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NME3Q13232 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NME3Q13232 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NME3Q13232 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NME3Q13232 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NME3Q13232 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NME3Q13232 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NME3Q13232 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NME3Q13232 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NME3Q13232 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NME3Q13232 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NME3Q13232 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NME3Q13232 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NME3Q13232 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NME3Q13232 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NME3Q13232 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NME3Q13232 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NME3Q13232 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NME3Q13232 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NME3Q13232 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NME3Q13232 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NME3Q13232 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NME3Q13232 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NME3Q13232 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NME3Q13232 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NME3Q13232 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NME3Q13232 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NME3Q13232 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NME3Q13232 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NME3Q13232 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NME3Q13232 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NME3Q13232 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NME3Q13232 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NME3Q13232 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NME3Q13232 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NME3Q13232 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NME3Q13232 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NME3Q13232 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NME3Q13232 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NME3Q13232 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NME3Q13232 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NME3Q13232 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NME3Q13232 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NME3Q13232 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NME3Q13232 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NME3Q13232 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NME3Q13232 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NME3Q13232 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NME3Q13232 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NME3Q13232 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NME3Q13232 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NME3Q13232 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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