Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

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Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDH17Q12864 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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