Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFFO1Q0D2I5 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFFO1Q0D2I5 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms