Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 GPALPP1-203ENST00000379151 1393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 NPM1P31-201ENST00000399021 764 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 LINC01945-201ENST00000419784 840 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 DAZAP2-204ENST00000439799 701 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AC103563.2-201ENST00000442200 597 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AC092164.1-203ENST00000444501 723 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AC103923.1-201ENST00000453229 1228 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AC109466.1-215ENST00000519750 516 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AC025252.1-201ENST00000535247 556 ntTSL 4 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 DAZAP2-208ENST00000549555 872 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AL354950.1-201ENST00000614150 568 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TNP2Q05952 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms