Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARID5AQ03989 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms