Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GJA4P35212 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GJA4P35212 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GJA4P35212 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GJA4P35212 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GJA4P35212 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GJA4P35212 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GJA4P35212 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GJA4P35212 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GJA4P35212 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GJA4P35212 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GJA4P35212 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GJA4P35212 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GJA4P35212 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GJA4P35212 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GJA4P35212 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GJA4P35212 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GJA4P35212 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GJA4P35212 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GJA4P35212 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GJA4P35212 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GJA4P35212 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GJA4P35212 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GJA4P35212 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GJA4P35212 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GJA4P35212 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GJA4P35212 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GJA4P35212 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GJA4P35212 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GJA4P35212 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GJA4P35212 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GJA4P35212 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GJA4P35212 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GJA4P35212 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GJA4P35212 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GJA4P35212 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GJA4P35212 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GJA4P35212 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GJA4P35212 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GJA4P35212 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GJA4P35212 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GJA4P35212 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GJA4P35212 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GJA4P35212 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GJA4P35212 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GJA4P35212 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GJA4P35212 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GJA4P35212 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GJA4P35212 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GJA4P35212 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GJA4P35212 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GJA4P35212 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GJA4P35212 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GJA4P35212 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GJA4P35212 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GJA4P35212 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GJA4P35212 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GJA4P35212 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GJA4P35212 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GJA4P35212 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GJA4P35212 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GJA4P35212 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GJA4P35212 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GJA4P35212 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GJA4P35212 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GJA4P35212 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GJA4P35212 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GJA4P35212 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GJA4P35212 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GJA4P35212 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GJA4P35212 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GJA4P35212 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GJA4P35212 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GJA4P35212 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GJA4P35212 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GJA4P35212 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GJA4P35212 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GJA4P35212 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GJA4P35212 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GJA4P35212 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GJA4P35212 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GJA4P35212 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GJA4P35212 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GJA4P35212 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GJA4P35212 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GJA4P35212 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GJA4P35212 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GJA4P35212 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GJA4P35212 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GJA4P35212 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GJA4P35212 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GJA4P35212 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GJA4P35212 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GJA4P35212 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJA4P35212 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJA4P35212 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJA4P35212 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJA4P35212 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJA4P35212 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJA4P35212 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms