Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TSPOP30536 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TSPOP30536 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TSPOP30536 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TSPOP30536 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TSPOP30536 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TSPOP30536 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TSPOP30536 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TSPOP30536 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TSPOP30536 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TSPOP30536 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TSPOP30536 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TSPOP30536 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
TSPOP30536 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TSPOP30536 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TSPOP30536 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TSPOP30536 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TSPOP30536 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
TSPOP30536 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TSPOP30536 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TSPOP30536 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TSPOP30536 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TSPOP30536 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TSPOP30536 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TSPOP30536 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TSPOP30536 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TSPOP30536 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TSPOP30536 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TSPOP30536 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TSPOP30536 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TSPOP30536 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TSPOP30536 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TSPOP30536 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TSPOP30536 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TSPOP30536 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TSPOP30536 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
TSPOP30536 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TSPOP30536 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TSPOP30536 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TSPOP30536 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TSPOP30536 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TSPOP30536 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TSPOP30536 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TSPOP30536 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TSPOP30536 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TSPOP30536 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TSPOP30536 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TSPOP30536 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TSPOP30536 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TSPOP30536 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TSPOP30536 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TSPOP30536 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TSPOP30536 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TSPOP30536 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TSPOP30536 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TSPOP30536 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TSPOP30536 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TSPOP30536 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TSPOP30536 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TSPOP30536 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TSPOP30536 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TSPOP30536 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TSPOP30536 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TSPOP30536 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TSPOP30536 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TSPOP30536 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TSPOP30536 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TSPOP30536 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TSPOP30536 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TSPOP30536 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TSPOP30536 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TSPOP30536 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TSPOP30536 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TSPOP30536 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TSPOP30536 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TSPOP30536 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TSPOP30536 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TSPOP30536 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TSPOP30536 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TSPOP30536 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TSPOP30536 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TSPOP30536 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TSPOP30536 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TSPOP30536 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TSPOP30536 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TSPOP30536 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TSPOP30536 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TSPOP30536 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TSPOP30536 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TSPOP30536 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TSPOP30536 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TSPOP30536 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TSPOP30536 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TSPOP30536 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TSPOP30536 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TSPOP30536 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TSPOP30536 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TSPOP30536 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TSPOP30536 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TSPOP30536 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.8 ms