Protein–RNA interactions for Protein: P15923

TCF3, Transcription factor E2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF3P15923 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCF3P15923 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCF3P15923 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCF3P15923 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCF3P15923 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TCF3P15923 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCF3P15923 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCF3P15923 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCF3P15923 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCF3P15923 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCF3P15923 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCF3P15923 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCF3P15923 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCF3P15923 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCF3P15923 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCF3P15923 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCF3P15923 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCF3P15923 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCF3P15923 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCF3P15923 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCF3P15923 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCF3P15923 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCF3P15923 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCF3P15923 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCF3P15923 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCF3P15923 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCF3P15923 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCF3P15923 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCF3P15923 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCF3P15923 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCF3P15923 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCF3P15923 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCF3P15923 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCF3P15923 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCF3P15923 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCF3P15923 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCF3P15923 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCF3P15923 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCF3P15923 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCF3P15923 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TCF3P15923 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCF3P15923 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TCF3P15923 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCF3P15923 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCF3P15923 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TCF3P15923 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCF3P15923 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCF3P15923 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCF3P15923 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCF3P15923 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCF3P15923 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCF3P15923 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCF3P15923 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TCF3P15923 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCF3P15923 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCF3P15923 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCF3P15923 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCF3P15923 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCF3P15923 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCF3P15923 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCF3P15923 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCF3P15923 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCF3P15923 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCF3P15923 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCF3P15923 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCF3P15923 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCF3P15923 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCF3P15923 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCF3P15923 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCF3P15923 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCF3P15923 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TCF3P15923 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCF3P15923 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCF3P15923 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCF3P15923 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCF3P15923 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCF3P15923 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCF3P15923 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCF3P15923 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCF3P15923 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCF3P15923 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCF3P15923 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCF3P15923 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCF3P15923 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TCF3P15923 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCF3P15923 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TCF3P15923 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCF3P15923 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCF3P15923 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCF3P15923 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCF3P15923 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCF3P15923 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCF3P15923 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCF3P15923 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCF3P15923 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCF3P15923 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF3P15923 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF3P15923 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF3P15923 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCF3P15923 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms