Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM228BP0C875 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms