Protein–RNA interactions for Protein: O43633

CHMP2A, Charged multivesicular body protein 2a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2AO43633 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHMP2AO43633 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms