Protein–RNA interactions for Protein: O15146

MUSK, Muscle, skeletal receptor tyrosine-protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUSKO15146 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MUSKO15146 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MUSKO15146 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MUSKO15146 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MUSKO15146 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MUSKO15146 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MUSKO15146 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MUSKO15146 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MUSKO15146 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MUSKO15146 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MUSKO15146 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MUSKO15146 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MUSKO15146 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MUSKO15146 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MUSKO15146 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MUSKO15146 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MUSKO15146 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MUSKO15146 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MUSKO15146 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MUSKO15146 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MUSKO15146 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MUSKO15146 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MUSKO15146 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MUSKO15146 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MUSKO15146 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MUSKO15146 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MUSKO15146 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MUSKO15146 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MUSKO15146 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MUSKO15146 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MUSKO15146 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MUSKO15146 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MUSKO15146 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MUSKO15146 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MUSKO15146 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MUSKO15146 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MUSKO15146 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MUSKO15146 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MUSKO15146 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MUSKO15146 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MUSKO15146 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MUSKO15146 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MUSKO15146 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MUSKO15146 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MUSKO15146 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MUSKO15146 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MUSKO15146 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MUSKO15146 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MUSKO15146 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MUSKO15146 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MUSKO15146 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MUSKO15146 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MUSKO15146 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MUSKO15146 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MUSKO15146 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MUSKO15146 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MUSKO15146 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MUSKO15146 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MUSKO15146 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MUSKO15146 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MUSKO15146 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MUSKO15146 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MUSKO15146 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MUSKO15146 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MUSKO15146 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MUSKO15146 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MUSKO15146 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MUSKO15146 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MUSKO15146 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MUSKO15146 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MUSKO15146 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MUSKO15146 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MUSKO15146 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MUSKO15146 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MUSKO15146 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MUSKO15146 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MUSKO15146 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MUSKO15146 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MUSKO15146 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MUSKO15146 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MUSKO15146 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MUSKO15146 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MUSKO15146 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MUSKO15146 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MUSKO15146 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MUSKO15146 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MUSKO15146 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MUSKO15146 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MUSKO15146 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MUSKO15146 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MUSKO15146 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MUSKO15146 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MUSKO15146 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MUSKO15146 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MUSKO15146 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MUSKO15146 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MUSKO15146 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MUSKO15146 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MUSKO15146 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MUSKO15146 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.9 ms