Protein–RNA interactions for Protein: C9JLW8

MCRIP1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCRIP1C9JLW8 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MCRIP1C9JLW8 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms