Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVV-1B6SEH8 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.2 ms