Protein–RNA interactions for Protein: A5PL33

KRBA1, Protein KRBA1, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRBA1A5PL33 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRBA1A5PL33 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms