Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y625

GPC6, Glypican-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC6Q9Y625 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC6Q9Y625 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC6Q9Y625 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC6Q9Y625 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC6Q9Y625 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC6Q9Y625 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC6Q9Y625 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC6Q9Y625 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC6Q9Y625 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPC6Q9Y625 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPC6Q9Y625 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPC6Q9Y625 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPC6Q9Y625 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPC6Q9Y625 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPC6Q9Y625 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPC6Q9Y625 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPC6Q9Y625 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GPC6Q9Y625 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPC6Q9Y625 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPC6Q9Y625 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPC6Q9Y625 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPC6Q9Y625 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GPC6Q9Y625 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GPC6Q9Y625 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GPC6Q9Y625 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GPC6Q9Y625 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPC6Q9Y625 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPC6Q9Y625 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPC6Q9Y625 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPC6Q9Y625 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPC6Q9Y625 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPC6Q9Y625 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPC6Q9Y625 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPC6Q9Y625 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPC6Q9Y625 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPC6Q9Y625 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPC6Q9Y625 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GPC6Q9Y625 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPC6Q9Y625 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPC6Q9Y625 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPC6Q9Y625 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPC6Q9Y625 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPC6Q9Y625 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPC6Q9Y625 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPC6Q9Y625 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPC6Q9Y625 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPC6Q9Y625 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPC6Q9Y625 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GPC6Q9Y625 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPC6Q9Y625 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPC6Q9Y625 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPC6Q9Y625 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPC6Q9Y625 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPC6Q9Y625 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPC6Q9Y625 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPC6Q9Y625 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPC6Q9Y625 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPC6Q9Y625 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPC6Q9Y625 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPC6Q9Y625 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPC6Q9Y625 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GPC6Q9Y625 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPC6Q9Y625 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPC6Q9Y625 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPC6Q9Y625 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPC6Q9Y625 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPC6Q9Y625 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPC6Q9Y625 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPC6Q9Y625 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPC6Q9Y625 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPC6Q9Y625 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPC6Q9Y625 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPC6Q9Y625 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPC6Q9Y625 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPC6Q9Y625 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC6Q9Y625 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC6Q9Y625 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC6Q9Y625 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC6Q9Y625 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC6Q9Y625 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC6Q9Y625 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC6Q9Y625 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC6Q9Y625 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC6Q9Y625 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC6Q9Y625 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC6Q9Y625 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC6Q9Y625 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC6Q9Y625 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPC6Q9Y625 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPC6Q9Y625 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPC6Q9Y625 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPC6Q9Y625 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPC6Q9Y625 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPC6Q9Y625 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPC6Q9Y625 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPC6Q9Y625 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPC6Q9Y625 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GPC6Q9Y625 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPC6Q9Y625 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPC6Q9Y625 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms