Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5G0

PCDHGB5, Protocadherin gamma-B5, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHGB5Q9Y5G0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCDHGB5Q9Y5G0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCDHGB5Q9Y5G0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCDHGB5Q9Y5G0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDHGB5Q9Y5G0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDHGB5Q9Y5G0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDHGB5Q9Y5G0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDHGB5Q9Y5G0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDHGB5Q9Y5G0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDHGB5Q9Y5G0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDHGB5Q9Y5G0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDHGB5Q9Y5G0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDHGB5Q9Y5G0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDHGB5Q9Y5G0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDHGB5Q9Y5G0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCDHGB5Q9Y5G0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCDHGB5Q9Y5G0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCDHGB5Q9Y5G0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCDHGB5Q9Y5G0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCDHGB5Q9Y5G0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCDHGB5Q9Y5G0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCDHGB5Q9Y5G0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCDHGB5Q9Y5G0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCDHGB5Q9Y5G0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCDHGB5Q9Y5G0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCDHGB5Q9Y5G0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCDHGB5Q9Y5G0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCDHGB5Q9Y5G0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCDHGB5Q9Y5G0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCDHGB5Q9Y5G0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCDHGB5Q9Y5G0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCDHGB5Q9Y5G0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCDHGB5Q9Y5G0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCDHGB5Q9Y5G0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCDHGB5Q9Y5G0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCDHGB5Q9Y5G0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCDHGB5Q9Y5G0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCDHGB5Q9Y5G0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PCDHGB5Q9Y5G0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCDHGB5Q9Y5G0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PCDHGB5Q9Y5G0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
PCDHGB5Q9Y5G0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCDHGB5Q9Y5G0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCDHGB5Q9Y5G0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PCDHGB5Q9Y5G0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCDHGB5Q9Y5G0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCDHGB5Q9Y5G0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCDHGB5Q9Y5G0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCDHGB5Q9Y5G0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCDHGB5Q9Y5G0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCDHGB5Q9Y5G0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCDHGB5Q9Y5G0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCDHGB5Q9Y5G0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PCDHGB5Q9Y5G0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCDHGB5Q9Y5G0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PCDHGB5Q9Y5G0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCDHGB5Q9Y5G0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PCDHGB5Q9Y5G0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PCDHGB5Q9Y5G0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCDHGB5Q9Y5G0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PCDHGB5Q9Y5G0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCDHGB5Q9Y5G0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PCDHGB5Q9Y5G0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCDHGB5Q9Y5G0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PCDHGB5Q9Y5G0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCDHGB5Q9Y5G0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCDHGB5Q9Y5G0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCDHGB5Q9Y5G0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCDHGB5Q9Y5G0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCDHGB5Q9Y5G0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PCDHGB5Q9Y5G0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCDHGB5Q9Y5G0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PCDHGB5Q9Y5G0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PCDHGB5Q9Y5G0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PCDHGB5Q9Y5G0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PCDHGB5Q9Y5G0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PCDHGB5Q9Y5G0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCDHGB5Q9Y5G0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PCDHGB5Q9Y5G0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PCDHGB5Q9Y5G0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCDHGB5Q9Y5G0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PCDHGB5Q9Y5G0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCDHGB5Q9Y5G0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PCDHGB5Q9Y5G0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PCDHGB5Q9Y5G0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCDHGB5Q9Y5G0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCDHGB5Q9Y5G0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCDHGB5Q9Y5G0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCDHGB5Q9Y5G0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCDHGB5Q9Y5G0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCDHGB5Q9Y5G0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCDHGB5Q9Y5G0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCDHGB5Q9Y5G0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCDHGB5Q9Y5G0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCDHGB5Q9Y5G0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PCDHGB5Q9Y5G0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCDHGB5Q9Y5G0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCDHGB5Q9Y5G0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCDHGB5Q9Y5G0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCDHGB5Q9Y5G0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms