Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
KDM2AQ9Y2K7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
KDM2AQ9Y2K7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
KDM2AQ9Y2K7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
KDM2AQ9Y2K7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
KDM2AQ9Y2K7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
KDM2AQ9Y2K7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
KDM2AQ9Y2K7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
KDM2AQ9Y2K7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
KDM2AQ9Y2K7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
KDM2AQ9Y2K7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
KDM2AQ9Y2K7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
KDM2AQ9Y2K7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
KDM2AQ9Y2K7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
KDM2AQ9Y2K7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
KDM2AQ9Y2K7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
KDM2AQ9Y2K7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
KDM2AQ9Y2K7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
KDM2AQ9Y2K7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC33.07■■■□□ 2.88
KDM2AQ9Y2K7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
KDM2AQ9Y2K7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
KDM2AQ9Y2K7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
KDM2AQ9Y2K7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
KDM2AQ9Y2K7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
KDM2AQ9Y2K7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
KDM2AQ9Y2K7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
KDM2AQ9Y2K7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
KDM2AQ9Y2K7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
KDM2AQ9Y2K7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
KDM2AQ9Y2K7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
KDM2AQ9Y2K7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
KDM2AQ9Y2K7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
KDM2AQ9Y2K7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
KDM2AQ9Y2K7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
KDM2AQ9Y2K7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
KDM2AQ9Y2K7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
KDM2AQ9Y2K7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
KDM2AQ9Y2K7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
KDM2AQ9Y2K7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
KDM2AQ9Y2K7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
KDM2AQ9Y2K7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
KDM2AQ9Y2K7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
KDM2AQ9Y2K7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
KDM2AQ9Y2K7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
KDM2AQ9Y2K7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
KDM2AQ9Y2K7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
KDM2AQ9Y2K7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
KDM2AQ9Y2K7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
KDM2AQ9Y2K7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
KDM2AQ9Y2K7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
KDM2AQ9Y2K7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
KDM2AQ9Y2K7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
KDM2AQ9Y2K7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
KDM2AQ9Y2K7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
KDM2AQ9Y2K7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
KDM2AQ9Y2K7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
KDM2AQ9Y2K7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
KDM2AQ9Y2K7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
KDM2AQ9Y2K7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
KDM2AQ9Y2K7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
KDM2AQ9Y2K7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
KDM2AQ9Y2K7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
KDM2AQ9Y2K7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
KDM2AQ9Y2K7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
KDM2AQ9Y2K7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
KDM2AQ9Y2K7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
KDM2AQ9Y2K7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
KDM2AQ9Y2K7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
KDM2AQ9Y2K7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
KDM2AQ9Y2K7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
KDM2AQ9Y2K7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC33■■■□□ 2.87
KDM2AQ9Y2K7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
KDM2AQ9Y2K7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
KDM2AQ9Y2K7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
KDM2AQ9Y2K7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
KDM2AQ9Y2K7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC33■■■□□ 2.87
KDM2AQ9Y2K7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
KDM2AQ9Y2K7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
KDM2AQ9Y2K7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
KDM2AQ9Y2K7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC32.99■■■□□ 2.87
KDM2AQ9Y2K7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
KDM2AQ9Y2K7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
KDM2AQ9Y2K7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
KDM2AQ9Y2K7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
KDM2AQ9Y2K7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
KDM2AQ9Y2K7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
KDM2AQ9Y2K7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
KDM2AQ9Y2K7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
KDM2AQ9Y2K7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
KDM2AQ9Y2K7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
KDM2AQ9Y2K7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
KDM2AQ9Y2K7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
KDM2AQ9Y2K7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
KDM2AQ9Y2K7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
KDM2AQ9Y2K7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
KDM2AQ9Y2K7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
KDM2AQ9Y2K7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
KDM2AQ9Y2K7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
KDM2AQ9Y2K7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
KDM2AQ9Y2K7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms