Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y297

BTRC, F-box/WD repeat-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BTRCQ9Y297 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BTRCQ9Y297 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BTRCQ9Y297 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BTRCQ9Y297 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BTRCQ9Y297 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BTRCQ9Y297 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BTRCQ9Y297 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BTRCQ9Y297 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BTRCQ9Y297 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BTRCQ9Y297 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BTRCQ9Y297 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BTRCQ9Y297 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BTRCQ9Y297 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BTRCQ9Y297 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BTRCQ9Y297 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BTRCQ9Y297 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
BTRCQ9Y297 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BTRCQ9Y297 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BTRCQ9Y297 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BTRCQ9Y297 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BTRCQ9Y297 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BTRCQ9Y297 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
BTRCQ9Y297 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BTRCQ9Y297 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BTRCQ9Y297 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BTRCQ9Y297 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BTRCQ9Y297 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BTRCQ9Y297 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BTRCQ9Y297 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BTRCQ9Y297 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BTRCQ9Y297 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BTRCQ9Y297 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
BTRCQ9Y297 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BTRCQ9Y297 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BTRCQ9Y297 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BTRCQ9Y297 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
BTRCQ9Y297 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
BTRCQ9Y297 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
BTRCQ9Y297 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BTRCQ9Y297 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BTRCQ9Y297 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BTRCQ9Y297 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BTRCQ9Y297 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BTRCQ9Y297 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BTRCQ9Y297 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
BTRCQ9Y297 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BTRCQ9Y297 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BTRCQ9Y297 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BTRCQ9Y297 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BTRCQ9Y297 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BTRCQ9Y297 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BTRCQ9Y297 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BTRCQ9Y297 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BTRCQ9Y297 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
BTRCQ9Y297 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BTRCQ9Y297 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BTRCQ9Y297 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BTRCQ9Y297 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BTRCQ9Y297 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BTRCQ9Y297 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BTRCQ9Y297 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BTRCQ9Y297 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BTRCQ9Y297 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BTRCQ9Y297 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BTRCQ9Y297 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BTRCQ9Y297 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BTRCQ9Y297 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BTRCQ9Y297 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BTRCQ9Y297 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BTRCQ9Y297 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BTRCQ9Y297 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BTRCQ9Y297 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BTRCQ9Y297 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BTRCQ9Y297 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BTRCQ9Y297 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BTRCQ9Y297 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BTRCQ9Y297 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BTRCQ9Y297 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BTRCQ9Y297 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BTRCQ9Y297 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BTRCQ9Y297 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BTRCQ9Y297 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BTRCQ9Y297 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BTRCQ9Y297 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BTRCQ9Y297 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BTRCQ9Y297 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BTRCQ9Y297 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BTRCQ9Y297 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BTRCQ9Y297 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BTRCQ9Y297 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BTRCQ9Y297 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BTRCQ9Y297 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BTRCQ9Y297 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BTRCQ9Y297 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BTRCQ9Y297 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BTRCQ9Y297 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BTRCQ9Y297 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BTRCQ9Y297 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BTRCQ9Y297 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BTRCQ9Y297 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms