Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y235

APOBEC2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC2Q9Y235 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOBEC2Q9Y235 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOBEC2Q9Y235 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOBEC2Q9Y235 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOBEC2Q9Y235 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOBEC2Q9Y235 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOBEC2Q9Y235 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOBEC2Q9Y235 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOBEC2Q9Y235 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOBEC2Q9Y235 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOBEC2Q9Y235 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOBEC2Q9Y235 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOBEC2Q9Y235 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOBEC2Q9Y235 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOBEC2Q9Y235 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOBEC2Q9Y235 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOBEC2Q9Y235 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOBEC2Q9Y235 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOBEC2Q9Y235 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
APOBEC2Q9Y235 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOBEC2Q9Y235 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOBEC2Q9Y235 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOBEC2Q9Y235 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOBEC2Q9Y235 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOBEC2Q9Y235 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOBEC2Q9Y235 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOBEC2Q9Y235 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOBEC2Q9Y235 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOBEC2Q9Y235 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOBEC2Q9Y235 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOBEC2Q9Y235 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOBEC2Q9Y235 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOBEC2Q9Y235 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOBEC2Q9Y235 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOBEC2Q9Y235 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOBEC2Q9Y235 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
APOBEC2Q9Y235 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOBEC2Q9Y235 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOBEC2Q9Y235 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOBEC2Q9Y235 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOBEC2Q9Y235 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
APOBEC2Q9Y235 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
APOBEC2Q9Y235 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
APOBEC2Q9Y235 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOBEC2Q9Y235 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOBEC2Q9Y235 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOBEC2Q9Y235 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOBEC2Q9Y235 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
APOBEC2Q9Y235 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOBEC2Q9Y235 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOBEC2Q9Y235 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOBEC2Q9Y235 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOBEC2Q9Y235 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOBEC2Q9Y235 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOBEC2Q9Y235 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOBEC2Q9Y235 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOBEC2Q9Y235 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOBEC2Q9Y235 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOBEC2Q9Y235 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOBEC2Q9Y235 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOBEC2Q9Y235 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOBEC2Q9Y235 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOBEC2Q9Y235 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOBEC2Q9Y235 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOBEC2Q9Y235 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOBEC2Q9Y235 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOBEC2Q9Y235 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOBEC2Q9Y235 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOBEC2Q9Y235 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOBEC2Q9Y235 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOBEC2Q9Y235 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOBEC2Q9Y235 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOBEC2Q9Y235 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBEC2Q9Y235 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBEC2Q9Y235 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBEC2Q9Y235 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOBEC2Q9Y235 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOBEC2Q9Y235 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOBEC2Q9Y235 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOBEC2Q9Y235 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOBEC2Q9Y235 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOBEC2Q9Y235 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOBEC2Q9Y235 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOBEC2Q9Y235 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
APOBEC2Q9Y235 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOBEC2Q9Y235 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
APOBEC2Q9Y235 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOBEC2Q9Y235 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOBEC2Q9Y235 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOBEC2Q9Y235 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOBEC2Q9Y235 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOBEC2Q9Y235 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
APOBEC2Q9Y235 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOBEC2Q9Y235 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBEC2Q9Y235 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBEC2Q9Y235 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBEC2Q9Y235 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBEC2Q9Y235 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBEC2Q9Y235 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOBEC2Q9Y235 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms