Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW6

SATB2, DNA-binding protein SATB2, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB2Q9UPW6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SATB2Q9UPW6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SATB2Q9UPW6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SATB2Q9UPW6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SATB2Q9UPW6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SATB2Q9UPW6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SATB2Q9UPW6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SATB2Q9UPW6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SATB2Q9UPW6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SATB2Q9UPW6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SATB2Q9UPW6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SATB2Q9UPW6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SATB2Q9UPW6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SATB2Q9UPW6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SATB2Q9UPW6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SATB2Q9UPW6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SATB2Q9UPW6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SATB2Q9UPW6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SATB2Q9UPW6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SATB2Q9UPW6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SATB2Q9UPW6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SATB2Q9UPW6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SATB2Q9UPW6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SATB2Q9UPW6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SATB2Q9UPW6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SATB2Q9UPW6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SATB2Q9UPW6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SATB2Q9UPW6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SATB2Q9UPW6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SATB2Q9UPW6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SATB2Q9UPW6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SATB2Q9UPW6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SATB2Q9UPW6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SATB2Q9UPW6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SATB2Q9UPW6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SATB2Q9UPW6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SATB2Q9UPW6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SATB2Q9UPW6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SATB2Q9UPW6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SATB2Q9UPW6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SATB2Q9UPW6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SATB2Q9UPW6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SATB2Q9UPW6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SATB2Q9UPW6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SATB2Q9UPW6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SATB2Q9UPW6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SATB2Q9UPW6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SATB2Q9UPW6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SATB2Q9UPW6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SATB2Q9UPW6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SATB2Q9UPW6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SATB2Q9UPW6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SATB2Q9UPW6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SATB2Q9UPW6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SATB2Q9UPW6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SATB2Q9UPW6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SATB2Q9UPW6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SATB2Q9UPW6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SATB2Q9UPW6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SATB2Q9UPW6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SATB2Q9UPW6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SATB2Q9UPW6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SATB2Q9UPW6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SATB2Q9UPW6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SATB2Q9UPW6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SATB2Q9UPW6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SATB2Q9UPW6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SATB2Q9UPW6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SATB2Q9UPW6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SATB2Q9UPW6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SATB2Q9UPW6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SATB2Q9UPW6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SATB2Q9UPW6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SATB2Q9UPW6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SATB2Q9UPW6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SATB2Q9UPW6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SATB2Q9UPW6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SATB2Q9UPW6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SATB2Q9UPW6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SATB2Q9UPW6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SATB2Q9UPW6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SATB2Q9UPW6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SATB2Q9UPW6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SATB2Q9UPW6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SATB2Q9UPW6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SATB2Q9UPW6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SATB2Q9UPW6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SATB2Q9UPW6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SATB2Q9UPW6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SATB2Q9UPW6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SATB2Q9UPW6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SATB2Q9UPW6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SATB2Q9UPW6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SATB2Q9UPW6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SATB2Q9UPW6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SATB2Q9UPW6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SATB2Q9UPW6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SATB2Q9UPW6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SATB2Q9UPW6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SATB2Q9UPW6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms