Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX12Q9UMY4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX12Q9UMY4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX12Q9UMY4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX12Q9UMY4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX12Q9UMY4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX12Q9UMY4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX12Q9UMY4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX12Q9UMY4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX12Q9UMY4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX12Q9UMY4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX12Q9UMY4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX12Q9UMY4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX12Q9UMY4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX12Q9UMY4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX12Q9UMY4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX12Q9UMY4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX12Q9UMY4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX12Q9UMY4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX12Q9UMY4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX12Q9UMY4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX12Q9UMY4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX12Q9UMY4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX12Q9UMY4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX12Q9UMY4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX12Q9UMY4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX12Q9UMY4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX12Q9UMY4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX12Q9UMY4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX12Q9UMY4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX12Q9UMY4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX12Q9UMY4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX12Q9UMY4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX12Q9UMY4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX12Q9UMY4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX12Q9UMY4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX12Q9UMY4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX12Q9UMY4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX12Q9UMY4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX12Q9UMY4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX12Q9UMY4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX12Q9UMY4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX12Q9UMY4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX12Q9UMY4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX12Q9UMY4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX12Q9UMY4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX12Q9UMY4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX12Q9UMY4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX12Q9UMY4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX12Q9UMY4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX12Q9UMY4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX12Q9UMY4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX12Q9UMY4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX12Q9UMY4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX12Q9UMY4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX12Q9UMY4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX12Q9UMY4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX12Q9UMY4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX12Q9UMY4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX12Q9UMY4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX12Q9UMY4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX12Q9UMY4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX12Q9UMY4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX12Q9UMY4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX12Q9UMY4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX12Q9UMY4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX12Q9UMY4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX12Q9UMY4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX12Q9UMY4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX12Q9UMY4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX12Q9UMY4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX12Q9UMY4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX12Q9UMY4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX12Q9UMY4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX12Q9UMY4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX12Q9UMY4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX12Q9UMY4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX12Q9UMY4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX12Q9UMY4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX12Q9UMY4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX12Q9UMY4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX12Q9UMY4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX12Q9UMY4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX12Q9UMY4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX12Q9UMY4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX12Q9UMY4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX12Q9UMY4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX12Q9UMY4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX12Q9UMY4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX12Q9UMY4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX12Q9UMY4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX12Q9UMY4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX12Q9UMY4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX12Q9UMY4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX12Q9UMY4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX12Q9UMY4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX12Q9UMY4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX12Q9UMY4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX12Q9UMY4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SNX12Q9UMY4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms