Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ABCF2Q9UG63 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ABCF2Q9UG63 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ABCF2Q9UG63 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ABCF2Q9UG63 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ABCF2Q9UG63 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ABCF2Q9UG63 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ABCF2Q9UG63 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ABCF2Q9UG63 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ABCF2Q9UG63 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ABCF2Q9UG63 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ABCF2Q9UG63 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ABCF2Q9UG63 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ABCF2Q9UG63 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ABCF2Q9UG63 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCF2Q9UG63 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCF2Q9UG63 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCF2Q9UG63 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCF2Q9UG63 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCF2Q9UG63 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCF2Q9UG63 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCF2Q9UG63 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCF2Q9UG63 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCF2Q9UG63 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCF2Q9UG63 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCF2Q9UG63 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCF2Q9UG63 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCF2Q9UG63 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCF2Q9UG63 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCF2Q9UG63 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCF2Q9UG63 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCF2Q9UG63 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCF2Q9UG63 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCF2Q9UG63 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCF2Q9UG63 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCF2Q9UG63 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCF2Q9UG63 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCF2Q9UG63 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCF2Q9UG63 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCF2Q9UG63 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCF2Q9UG63 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCF2Q9UG63 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ABCF2Q9UG63 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ABCF2Q9UG63 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ABCF2Q9UG63 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ABCF2Q9UG63 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
ABCF2Q9UG63 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ABCF2Q9UG63 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ABCF2Q9UG63 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ABCF2Q9UG63 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ABCF2Q9UG63 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ABCF2Q9UG63 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ABCF2Q9UG63 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ABCF2Q9UG63 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ABCF2Q9UG63 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ABCF2Q9UG63 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ABCF2Q9UG63 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ABCF2Q9UG63 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ABCF2Q9UG63 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ABCF2Q9UG63 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ABCF2Q9UG63 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ABCF2Q9UG63 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ABCF2Q9UG63 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ABCF2Q9UG63 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ABCF2Q9UG63 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ABCF2Q9UG63 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ABCF2Q9UG63 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ABCF2Q9UG63 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ABCF2Q9UG63 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ABCF2Q9UG63 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ABCF2Q9UG63 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ABCF2Q9UG63 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ABCF2Q9UG63 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ABCF2Q9UG63 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ABCF2Q9UG63 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ABCF2Q9UG63 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ABCF2Q9UG63 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ABCF2Q9UG63 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ABCF2Q9UG63 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ABCF2Q9UG63 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ABCF2Q9UG63 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ABCF2Q9UG63 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ABCF2Q9UG63 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ABCF2Q9UG63 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ABCF2Q9UG63 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ABCF2Q9UG63 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ABCF2Q9UG63 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ABCF2Q9UG63 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ABCF2Q9UG63 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ABCF2Q9UG63 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ABCF2Q9UG63 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ABCF2Q9UG63 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ABCF2Q9UG63 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ABCF2Q9UG63 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
ABCF2Q9UG63 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ABCF2Q9UG63 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ABCF2Q9UG63 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ABCF2Q9UG63 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ABCF2Q9UG63 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ABCF2Q9UG63 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms