Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y5

CAMSAP3, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMSAP3Q9P1Y5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAMSAP3Q9P1Y5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CAMSAP3Q9P1Y5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CAMSAP3Q9P1Y5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAMSAP3Q9P1Y5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAMSAP3Q9P1Y5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAMSAP3Q9P1Y5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAMSAP3Q9P1Y5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAMSAP3Q9P1Y5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CAMSAP3Q9P1Y5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CAMSAP3Q9P1Y5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAMSAP3Q9P1Y5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAMSAP3Q9P1Y5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAMSAP3Q9P1Y5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAMSAP3Q9P1Y5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAMSAP3Q9P1Y5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAMSAP3Q9P1Y5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAMSAP3Q9P1Y5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAMSAP3Q9P1Y5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAMSAP3Q9P1Y5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAMSAP3Q9P1Y5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAMSAP3Q9P1Y5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CAMSAP3Q9P1Y5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAMSAP3Q9P1Y5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAMSAP3Q9P1Y5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAMSAP3Q9P1Y5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAMSAP3Q9P1Y5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAMSAP3Q9P1Y5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAMSAP3Q9P1Y5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAMSAP3Q9P1Y5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAMSAP3Q9P1Y5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAMSAP3Q9P1Y5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAMSAP3Q9P1Y5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAMSAP3Q9P1Y5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAMSAP3Q9P1Y5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CAMSAP3Q9P1Y5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAMSAP3Q9P1Y5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAMSAP3Q9P1Y5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CAMSAP3Q9P1Y5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAMSAP3Q9P1Y5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAMSAP3Q9P1Y5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAMSAP3Q9P1Y5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAMSAP3Q9P1Y5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAMSAP3Q9P1Y5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CAMSAP3Q9P1Y5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAMSAP3Q9P1Y5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAMSAP3Q9P1Y5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAMSAP3Q9P1Y5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAMSAP3Q9P1Y5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAMSAP3Q9P1Y5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAMSAP3Q9P1Y5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAMSAP3Q9P1Y5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAMSAP3Q9P1Y5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAMSAP3Q9P1Y5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAMSAP3Q9P1Y5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAMSAP3Q9P1Y5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAMSAP3Q9P1Y5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAMSAP3Q9P1Y5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAMSAP3Q9P1Y5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAMSAP3Q9P1Y5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAMSAP3Q9P1Y5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAMSAP3Q9P1Y5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAMSAP3Q9P1Y5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAMSAP3Q9P1Y5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAMSAP3Q9P1Y5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAMSAP3Q9P1Y5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAMSAP3Q9P1Y5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAMSAP3Q9P1Y5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAMSAP3Q9P1Y5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAMSAP3Q9P1Y5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAMSAP3Q9P1Y5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAMSAP3Q9P1Y5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAMSAP3Q9P1Y5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAMSAP3Q9P1Y5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CAMSAP3Q9P1Y5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CAMSAP3Q9P1Y5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CAMSAP3Q9P1Y5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAMSAP3Q9P1Y5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAMSAP3Q9P1Y5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAMSAP3Q9P1Y5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAMSAP3Q9P1Y5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CAMSAP3Q9P1Y5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAMSAP3Q9P1Y5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAMSAP3Q9P1Y5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAMSAP3Q9P1Y5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAMSAP3Q9P1Y5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAMSAP3Q9P1Y5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAMSAP3Q9P1Y5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAMSAP3Q9P1Y5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CAMSAP3Q9P1Y5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAMSAP3Q9P1Y5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAMSAP3Q9P1Y5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAMSAP3Q9P1Y5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAMSAP3Q9P1Y5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAMSAP3Q9P1Y5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CAMSAP3Q9P1Y5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAMSAP3Q9P1Y5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAMSAP3Q9P1Y5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAMSAP3Q9P1Y5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAMSAP3Q9P1Y5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms