Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY65

TUBA8, Tubulin alpha-8 chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA8Q9NY65 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBA8Q9NY65 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBA8Q9NY65 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBA8Q9NY65 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBA8Q9NY65 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBA8Q9NY65 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBA8Q9NY65 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBA8Q9NY65 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBA8Q9NY65 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBA8Q9NY65 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBA8Q9NY65 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBA8Q9NY65 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBA8Q9NY65 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBA8Q9NY65 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBA8Q9NY65 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBA8Q9NY65 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBA8Q9NY65 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBA8Q9NY65 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBA8Q9NY65 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBA8Q9NY65 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBA8Q9NY65 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBA8Q9NY65 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBA8Q9NY65 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBA8Q9NY65 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBA8Q9NY65 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBA8Q9NY65 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBA8Q9NY65 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBA8Q9NY65 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBA8Q9NY65 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBA8Q9NY65 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBA8Q9NY65 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBA8Q9NY65 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBA8Q9NY65 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBA8Q9NY65 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBA8Q9NY65 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBA8Q9NY65 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBA8Q9NY65 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBA8Q9NY65 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBA8Q9NY65 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBA8Q9NY65 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBA8Q9NY65 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBA8Q9NY65 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBA8Q9NY65 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBA8Q9NY65 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBA8Q9NY65 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBA8Q9NY65 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBA8Q9NY65 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBA8Q9NY65 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBA8Q9NY65 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBA8Q9NY65 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBA8Q9NY65 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBA8Q9NY65 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBA8Q9NY65 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBA8Q9NY65 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBA8Q9NY65 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBA8Q9NY65 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBA8Q9NY65 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBA8Q9NY65 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBA8Q9NY65 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TUBA8Q9NY65 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBA8Q9NY65 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBA8Q9NY65 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBA8Q9NY65 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBA8Q9NY65 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBA8Q9NY65 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBA8Q9NY65 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBA8Q9NY65 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBA8Q9NY65 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBA8Q9NY65 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBA8Q9NY65 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBA8Q9NY65 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBA8Q9NY65 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBA8Q9NY65 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBA8Q9NY65 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBA8Q9NY65 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBA8Q9NY65 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBA8Q9NY65 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBA8Q9NY65 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBA8Q9NY65 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBA8Q9NY65 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBA8Q9NY65 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBA8Q9NY65 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBA8Q9NY65 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBA8Q9NY65 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBA8Q9NY65 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBA8Q9NY65 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBA8Q9NY65 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBA8Q9NY65 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBA8Q9NY65 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBA8Q9NY65 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBA8Q9NY65 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBA8Q9NY65 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBA8Q9NY65 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBA8Q9NY65 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBA8Q9NY65 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBA8Q9NY65 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBA8Q9NY65 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBA8Q9NY65 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBA8Q9NY65 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBA8Q9NY65 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms